AQU Catalunya avalua ensenyaments, centres, serveis i institucions universitaris catalans. Des de l'any 2011 l'Agència centra la seva activitat d'avaluació en la verificació, la modificació i el seguiment dels títols oficials.
Fins al 2004 l'Agència va avaluar la pràctica totalitat (335) dels ensenyaments que encara no havien estat adaptats a l'EEES. A partir de 2004 va dur a terme l'avaluació prèvia dels títols universitaris, a través del Pla pilot d'adaptació de les titulacions a l'EEES, 2004-2006 (82 graus i 17 màsters), i dels Programes Oficials de Postgrau, 2005-2008 (473 màsters). Des del 2008 AQU ha avaluat tots els centres adscrits de les universitats catalanes que presentaven propostes de titulacions adaptades a l'EEES, i també ha impulsat la implantació de Sistemes de Garantia Interna de la Qualitat a les universitats catalanes, a través del programa AUDIT.
Els graus avaluats fins a 2010 inclouen les titulacions prèvies a la implantació de l'EEES corresponents a
llicenciatures, diplomatures i graus participants en el Pla pilot d'adaptació a l'EEES.
8.2.2013